1969 : Les médicaments – Editions du Seuil, Collection Microcosme
1970 : Evolution et sexualité des plantes – Editions Horizons de France, nouvelle édition 1975
1971 : Drogues et plantes magiques – Editions Horizons de France, nouvelle édition 1983 Fayard
1977 : L’Homme re-naturé – Editions du Seuil, Prix européen d’écologie
1979 : Les drogues : leur histoire, leurs effets – Editions Douin
1980 : Les plantes : amours et civilisations végétales – Editions Fayard, nouvelle édition 1981
1981 : La médecine par les plantes – Editions Fayard – nouvelle édition 1986
1981 : La prodigieuse aventure des plantes – Coauteur J.-P. Cuny – Editions Fayard, réédition 1986
1983 : Drogues et plantes magiques – Editions Fayard
1984 : La vie sociale des plantes – Editions Fayard, nouvelle édition 1986
1986 : Mes plus belles histoires de plantes – Editions Fayard
1988 : Le piéton de Metz – Photographies Christian Legay – Editions Balland, Serpenoise
1988 : Fleurs, fêtes, saisons – Editions Fayard
1990 : Le tour du monde d’un écologiste – Editions Fayard
1992 : Au fond de mon jardin – Editions Fayard
1993 : Des légumes – Editions Fayard
1993 : Une leçon de nature avec des lettres sur la botaniques de J.-J Rousseau – Ed. P.U.F.
1993 : Le monde des plantes : entretiens avec Danielle Fournier – Editions du Seuil
1994 : Des Fruits – Editions Fayard
1995 : Dieu de l’Univers. Science et foi – Editions Fayard
1996 : De l’univers à l’être : réflexions sur l’évolution – Editions Fayard
1996 : Les langages secrets de la nature (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
1997 : Les plantes en péril – Editions Fayard
1998 : Le jardin de l’âme – Editions Fayard
1998 : Plantes et aliments transgéniques – Editions Fayard
1999 : La plus belle histoire des plantes – Editions du Seuil
1999 : La cannelle et le panda : les grands naturalistes explorateurs du monde – Ed.Fayard
2000 : La terre en héritage – Editions Fayard
2000 : Variations sur les fêtes et les saisons – Editions Le pommier
2000 : A l’écoute des arbres (photos : Bernard Boullet) – Editions Albin Michel
2000 : La vie est mon jardin – Editions Alice (Belgique)
2001 : Les nouveaux remèdes naturels – Editions Fayard
2002 : Les épices – Editions Fayard
2002 : Robert Schuman – Editions Conseil Général Moselle et serge Domici
2003 : L’avenir droit dans les yeux – Entretiens avec Martine Leca – Editions Fayard
2003 : La loi de la jungle (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2004 : Dieu en son jardin : entretiens avec Rachel et Alphonse Goettmann – Ed.Desclée de Brouwer
2004 : La solidarité chez les plantes, les animaux, les humains (avec Franck Steffan) – Ed. Fayard
2004 : Les vertus des plantes (photos : Peter Lippmann) – Editions Du Chêne
2005 : Le nouveau tour du monde d’un écologiste (avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2006 : Après nous le déluge ? (JM Pelt et Gilles-Éric Séralini) – Editions Flammarion et Fayard
2006 : Ces plantes que l’on mange (photos : Rob White) – Editions Du Chêne
2007 : C’est vert et ça marche ! (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2007 : La beauté des fleurs et des plantes décoratives (photos Virginie Pérocheau) – Ed. Du Chêne
2008 : Nature et spiritualité (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2008 : Le monde s’est-il créé tout seul ? (coauteur) – Editions Albin Michel
2009 : La raison du plus faible (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2009 : Herbier de fleurs sauvages – Editions Du Chêne
2010 : Les dons précieux de la nature – Editions Fayard
2010 : Quelle écologie pour demain – Editions L’esprit du temps
2010 : L’écologie pour tous – Editions du Jubilé
2010 : Les voies du bonheur (texte : JM Pelt – photos : Sebastião Salgado) – Editions La Martinière
2011 : L’évolution vue par un botaniste – Editions Fayard
2011 : Heureux les simples – Editions Flammarion
2012 : Cessons de tuer la terre pour nourrir l’homme ! (avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2013 : Héros d’Humanité – Editions Flammarion
2013 : Carnets de voyage d’un botaniste (en collaboration avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2014 : Le monde a-t-il un sens ? (coécrit avec Pierre Rabhi) – Editions Fayard
2014 : Les plantes qui guérissent, qui nourrissent, qui décorent – Editions du Chêne
2015 : Légumes d’ailleurs et d’autrefois (avec Franck Steffan) – Editions Fayard
2015 : C’est quoi l’écologie (Illustrations Pascal Lemaitre) – Editions L’Aube
2015 : Manifeste pour la beauté du monde (coécrit avec Soeur Marie Keyrouz) – Editions Cherche Midi
2015 : L’Ame de la nature (coécrit avec Paul Couturiau) – Genèse édition
2015 : Les voies du bonheur – Editions Fayard
2015 : L’homme renaturé (8 titres) – Editions Robert Laffont
2016 : Sauver l’homme et la nature – Editions Fayard